ד"ר רון אורבך

מרצה בכיר Senior Lecturer
דוא"ל בר-אילן
ron.orbach@biu.ac.il
תחומי עניין

The cytoskeleton of the cilia and associated ciliopathies  

תחום הוראה
ביולוגיה מבנית
ביוכימיה
ביופיסיקה
תחומי מחקר
ביוכימיה של הסילייה ומחלות סיליופטיות
מרכזי מחקר
הפקולטה לרפואה ע"ש עזריאלי, אוניברסיטת בר-אילן, צפת
    קורות חיים

    ד"ר רון אורבך הוא מרצה בכיר החוקר את הסיליום.

    מחקר

    הסיליום (cilium) האאוקריוטי הינו אברון דמוי שערה השמור אבולוציונית - החל מפרוטוזואה ועד בני אדם. מגוון מחקרים מהשנים האחרונות זיהה את חשיבותה של הסיליה לתנועה, חישה והתפתחות. בהתאם לתפקידה החשוב, נמצא שפגיעה בבניה ובפעילות הסיליה עשויים להוביל למגוון פתולוגיות שונות הנקראות  ciliopathies. המחקר במעבדה מתמקד בקשר בין מבנה שלד הסיליה לפעילותה וכן את הקשר לפתולוגיות שונות הנובעות מפגיעה בסיליה. כמודל מחקר נשתמש בעיקר באצה החד-תאית Chlamydomonas reinhardtii , אשר מהווה מודל מחקר מבוסס לסיליה ושימשה במחקרים רבים להבנת המבנה והתפקוד של הסיליה. המעבדה תתמקד בשלושה תחומי עניין מרכזים: (1) הסידור המרחבי של חלבוני הסיליה. (2) המנגנונים המולקולריים המעורבים ביציבות המבנית של הסיליה. (3) המנגנונים המולקולריים המעורבים בקביעת אורך הסיליה. המעבדה משלבת מגוון שיטות אינטר-דיסציפלינאריות, ביוכימיה קלאסיות ומיקרוסקופיה מתקדמת.

    פרסומים

    1.    Luchniak A, Kuo YW, McGuinness C, Sutradhar S, Orbach R, Mahamdeh M, Howard J (2022) Dynamic microtubules slow down during their shrinkage phase, Biophys J, 122, 616-623.
    2.    Orbach R, Howard J (2020) Purification of Ciliary Tubulin from Chlamydomonas reinhardtii, Curr Protoc Protein Sci, 100, e107. DOI: 10.1002/cpps.107.
    3.    Orbach R, Howard J (2019) The Dynamic and Structural Properties of Axonemal Tubulins Support the High Length Stability of Cilia, Nature Commun, 10, 1838, DOI:10.1038/s41467-019-09779-6.
    4.    Lilienthal S, Klein M, Orbach R, Remacle F, Levine RD, Willner I (2017) Continuous Variables Logic via Coupled Automata Using a DNAzyme Cascade with Feedback, Chem Sci, 8, 2161-2168. 
    5.    Lilienthal S, Shpilt Z, Wang F, Orbach R, Willner I (2015) Programmed DNAzyme-Triggered Dissolution of DNA-Based Hydrogels: Means for Controlled Release of Biocatalysts and for the Activation of Enzyme Cascades, ACS Appl Mater Interfaces, 7, 8923-8931. 
    6.    Heleg-Shabtai V, Aizen R, Orbach R, Aleman-Garcia MA, Willner I (2015) Gossypol-Crosslinked Boronic Acid-Modified Hydrogels: A Functional Matrix for the Controlled Release of an Anti-Cancer Drug, Langmuir, 31, 2237-2242. 
    7.    Guo W, Lu CH, Orbach R, Wang F, Qi XJ, Cecconello A, Seliktar D, Willner I (2015) pH-Stimulated DNA Hydrogels Exhibiting Shape-Memory Properties, Adv Mater, 27, 73-78. 
    8.    Freage L, Wang F, Orbach R, Willner I (2014) Multiplexed Analysis of Genes and of Metal Ions Using Enzyme/DNAzyme Amplification Machineries, Anal Chem, 86, 11326-11333. 
    9.    Guo W, Lu CH, Qi XJ, Orbach R, Fadeev M, Yang HH, Willner I (2014) Switchable Bifunctional Stimuli-Triggered Poly-N-Isopropylacrylamide/DNA Hydrogels, Angew Chem Int Ed, 53, 10134-10138. # Selected by referees as very important paper (VIP)
    10.    Orbach R, Wang F, Lioubashevski O, Remacle F, Levine RD, Willner I (2014) A Full-Adder Based on Reconfigurable DNA-hairpin Inputs and DNAzyme Computing Modules, Chem Sci, 5, 3381-3387. # Selected as hot paper; Cover page 
    11.    Aleman-Garcia MA, Orbach R, Willner I (2014) Ion-Responsive Hemin/G-Quadruplexes for Switchable DNAzyme and Enzyme Functions, Chem Eur J, 20, 5619-5624. 
    12.    Guo W, Qi XJ, Orbach R, Lu CH, Mironi-Harpaz I, Seliktar D, Yang HH, Willner I (2014) Reversible Ag+-Crosslinked DNA Hydrogels, Chem Commun, 50, 4065-4068. 
    13.    Orbach R, Remacle F, Levine RD, Willner I (2014) DNAzyme-Based 2:1 and 4:1 Multiplexers and 1:2 Demultiplexer, Chem Sci, 5, 1074-1081. # Selected as hot paper 
    14.    Guo W*, Orbach R* (co-first), Mironi-Harpaz I, Seliktar D, Willner I (2013) Fluorescent DNA Hydrogels Composed of Nucleic Acid-Stabilized Silver Nanoclusters, Small, 9, 3748-3752. 
    15.    Orbach R, Guo W, Wang F, Lioubashevski O, Willner I (2013) Self-Assembly of Luminescent Ag Nanocluster-Functionalized Nanowire, Langmuir, 29, 13066-13071. 
    16.    Wang F, Freage L, Orbach R, Willner I (2013) Autonomous Replication of Nucleic Acids by Polymerization/Nicking Enzyme/DNAzyme Cascades for the Amplified Detection of DNA and the Aptamer-Cocaine Complex, Anal Chem, 85, 8196-8203.
    17.    Lu CH, Qi XJ, Orbach R, Yang HH, Mironi-Harpaz I, Seliktar D, Willner I (2013) Switchable Catalytic Acrylamide Hydrogels Cross-Linked by Hemin/G-Quadruplexes, Nano Lett, 13, 1298-1302. 
    18.    Orbach R, Remacle F, Levine RD, Willner I (2012) Logic Reversibility and Thermodynamic Irreversibility Demonstrated by DNAzyme Based Toffoli and Fredkin Logic Gates, Proc Natl Acad Sci USA, 109, 21228-21233. 
    19.    Wang F, Orbach R, Willner I (2012) Detection of Metal Ions (Cu2+, Hg2+) and Cocaine by Using Ligation DNAzyme Machinery, Chem Eur J, 18, 16030-16036. 
    20.    Orbach R, Mostinski L, Wang F, Willner I (2012) Nucleic Acid Driven DNA Machineries Synthesizing Mg2+-Dependent DNAzymes: An Interplay Between DNA Sensing and Logic Gate Operations, Chem Eur J, 18, 14689-14694. 
    21.    Orbach R, Mironi-Harpaz I, Adler-Abramovich, L, Mossou E, Mitchell E, Forsyth VT, Gazit E, Seliktar D (2012) The Rheological and Structural Properties of Fmoc-Peptide Based Hydrogels: The Effect of Aromatic Molecular Architecture on Self-Assembly and Physical Characteristics, Langmuir, 28, 2015–2022. 
    22.    Shimron S, Wang F, Orbach R, Willner I (2012) Amplified Detection of DNA Through the Enzyme-Free Autonomous Assembly of Hemin/G-Quadruplex DNAzyme Nanowires, Anal Chem, 84, 1042-1048. 
    23.    Wang F, Elbaz E, Orbach R, Magen N, Willner I (2011) Amplified Analysis of DNA by the Autonomous Assembly of Polymers Consisting of DNAzyme Wires, J Am Chem Soc, 133, 17149–17151. (IF-15.419, Chemistry, Multidisciplinary, 15/178, Q1, 263 citations)
    24.    Wilner O, Orbach R, Henning A, Teller C, Yehezkeli O, Mertig M, Harries D, Willner I (2011) Self-Assembly of DNA Nanotubes with Controllable Diameters, Nature Commun, 2, 540, DOI: 10.1038/ncomms1535. 

    25.    Balogh D, Tel-Vered R, Riskin M, Orbach R, Willner I (2011) Electrified Au Nanoparticle Sponges with Controlled Hydrophilic/Hydrophobic Properties, ACS Nano, 5, 299-306.
    26.    Frisman I, Orbach R, Seliktar D, Bianco-Peled, H (2010) Structural Investigation of PEG-Fibrinogen Conjugates, J Mater Sci Mater Med, 21, 73-80.
    27.    Elbaz J, Wang ZG, Orbach R, Willner I (2009) pH-stimulated Concurrent Mechanical Activation of Two DNA “Tweezers” – A “SET-RESET” Logic Gate System, Nano Lett, 9, 4510–4514.
    28.    Amdursky N*, Orbach R* (co-first), Gazit E, Huppert D (2009) Probing the Inner Cavities of Hydrogels by Proton Diffusion, J Phys Chem C, 113, 19500–19505. 
    29.    Orbach R, Adler-Abramovich L, Zigerson S, Mironi-Harpaz I, Seliktar D, Gazit E (2009) Self-Assembled Fmoc-Peptides as a Platform for The Formation of Nanostructures and Hydrogels, Biomacromolecules, 10, 2646-2651. 

    תאריך עדכון אחרון : 05/08/2024