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Director Research Institute and Clinical Microbiology Clinic, Tzafon Medical Center

Prof. Avi Peretz

Director Research Institute and Clinical Microbiology Clinic, Tzafon Medical Center
טלפון
04-6652941
דוא"ל
aperetz@tzmc.gov.il
משרד
Tzafon Medical Center, Research Institute, Building No. 26
תחומי עניין

Bacterial virulence factors
Diagnostic microbiology and rapid diagnosis of infections
Hospital-acquired infections
Host–pathogen interaction

תחומי מחקר
Bacterial virulence factors
מרכזי מחקר
Tzafon Medical Center (previously Baruch Padeh)
קורות חיים

Dr. Peretz is the Director of the Research Institute and Clinical Microbiology Clinic, Tzafon Medical Center.

מחקר

Infectious diseases are one of the most common causes of death worldwide. Among the reasons for this we can list the increase in the resistance  rate  of bacteria to antibiotics, alongside a sharp peak in the rate of hospital acquired infections. One of the challenges in the field is to identify the disease cause (bacterium, virus, parasite or fungus) quickly using various diagnostic tools, and to choose the appropriate treatment, for example, antibiotics.

As part of its activities the laboratory researches the virulence mechanisms of various bacteria, such as the ability to form biofilm, toxins that cause various damages, as well as the response of the immune system and the relationship between the pathogen and the host. The laboratory closely collaborates with various research laboratories around the world and in Israel, and takes part in important multi-center international studies. Many of the studies conducted in the laboratory include the use of clinical samples collected from patients with various infectious diseases, as well as the use of animal models and cell cultures.

In recent years, the laboratory focuses on the research of on Helicobacter pylori and Clostridioides difficile, and holds the largest bacterial bank in Israel.

פרסומים
  1. Peretz  A,  On  A,  Koiefman  H,  Brodsky  D,  Isakovich  N,  Glyatman  T,  Paritsky  M.  BACTEC  TM  FX  System  as  a  tool  for  culturing  gastric  biopsies  and  Helicobacter  pylori  diagnosis.  Eur  J  Clin  Microbiol  Infect  Dis.  2013;32:1541-1543.
  2. Peretz  A,  Dinisman-Zavulunov  E,  Koifman  A,  Brodsky  D,  Isakovich  N,  Glyatman  T,  Pastukh  N,  Paritsky  M.  Susceptibility  of  45  Streptococcus  bovis  isolates  to  five  antibiotic  agents.  Int  J  Antimicrob  Agents.  2013;43:298-299.
  3. Peretz  A,  Koiefman  A,  Dinisman  E,  Brodsky  D,  Labay  K.  Do  wheelchairs  spread pathogenic  bacteria  within  hospital  walls?  World  J  Microb  Biol.  2013;30:385-387.
  4. Graffi  S,  Peretz  A,  Jabaly  H,  Koiefman  A,  Naftali  M.  Acanthamoeba  keratitis:  study  of  the  5-year  incidence  in  Israel.  Br  J  Ophthalmol.  2013;97:1382-1383.
  5. Peretz  A,  Paritsky  M,  Nasser  O,  Brodsky  D,  Glyatman  T,  Segal  S,  On  A.  Resistance  of  Helicobacter  pylori  to  tetracycline,  amoxicillin,  clarithromycin  and  metronidazole  in  Israeli  children  and  adults.  J  Antibiot.  2014;67:555-557.
  6. Peretz  A,  Labay  K,  Zonis  Z,  Glikman  D.  Disengagement  does  not  apply  to  bacteria  -  a  hig  carriage  rate  of  antibiotic-resistant  pathogens  among  Syrian  civilians  treated  in  Israeli  hospitals.  Clin  Infect  Dis.  2014;59:753-754.
  7. Peretz  A,  On  A,  Koiefman  A,  Brodsky  D,  Isakovich  N,  Glyatman  T,  Paritsky  M.  An  efficiency  comparison  between  three  invasive  methods  for  the  diagnosis  of  Helicobacter  pylori  infections:  culture  from  stomach  biopsy,  rapid  urease  test  (CUTest®(  and  histologic  examination  of  gastric  biopsy.  Ann  Clin  Lab  Sci.  2014;45:148-151.
  8. Paritsky  M,  Pastukh  N,  Brodsky  D,  Isakovich  N,  Peretz  A.  Association  of  Streptococcus  bovis  presence  in  colonic  content  with  advanced  colonic  lesion.  World  J  Gastroenterol.  2015;21(18):5663-5667.
  9. Peretz  A,  Paritsky  M,  Pastukh  N,  Koiefman  A,  Brodsky  D,  Glyatman  T,  On  A.  Improvement  and  optimization  of  classical  gastric  biopsy  culture  technique  for  Helicobacter  pylori  diagnosis  by  applying  trypsin.  J  Med  Microbiol.  2015;64:642-645.
  10. Peretz  A,  Paritsky  M,  Dinisman  E,  Pastukh  N,  Glyatman  T,  On  A.  Susceptibility  of Helicobacter  pylori  to  levofloxacin  and  rifampicin  in  Israel.  Microb  Drug  Resist.  2015;21(4):448-451.
  11. Nitzan  O,  Peretz  A,  Pastukh  N,  Lorber  M.  Should  prophylaxis  for  Pneumocystis  jirovecii  pneumonia  be  considered  in  patients  with  a  CD4  count  higher  than  200/mm3?  AIDS.  2015;29:2533-2534.
  12. Peretz  A,  Isakovich  N,  Pastukh  N,  Koiefman  A,  Glyatman  T,  Brodsky  D.  Performance  of  Gram  staining  on  blood  cultures  flagged  negative  by  automated  blood  culture  system.  Eur  J  Clin  Microbiol  Infect  Dis.  2015;34:1539-1541. 
  13. Padawer  D,  Pastukh  N,  Nitzan  O,  Labay  K,  Aharon  I,  Brodsky  D,  Glyatman  T,  Peretz   Catheter-Associated  Candiduria:  Risk  Factors,  Medical  Interventions,  and  Antifungal  Susceptibility.  Am  J  Infect  Control.  2015;43(7):19-22.
  14. Peretz  A,  Geffen  G,  Socea  S,  Pastukh  N,  Graffi  S.  Comparison  of  fluorescence  microscopy  and  different  growth  media  culture  methods  for  Acanthamoeba  keratitis  diagnosis.  Am  J  Trop  Med  Hyg.  2015;93(2):316-318.
  15. Wolf  M,  Peleg  D,  Rechnitzer  H,  Portnov  I,  Salim  R,  Shalev  S,  Keness  Y,  Dan  R,  Ben-Ami  M,  Peretz  A,  Kushnir  A,  Ben-Shachar  I.  Reconsidering  the  current  preterm  premature  rupture  of  membranes  antibiotic  prophylactic  protocol.  Am  J  Perinatol.  2015;32(13):1247-1250.
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  17. Lerner   A,   Solter  E,  Rachi  E,  Adler  A,  Rechnitzer  H,  Miron  D,  Krupnick  L,  Sela  S,  Aga  E,  Ziv  Y,  Peretz  A,  Labbay  K,  Rahav  G,  Geffen  Y,  Hussein  K,  Eluk  O,  Carmeli  Y,  Schwaber  M.  Detection  and  characterization  of  carbapenemase-producing  Enterobacteriaceae  in  wounded  Syrian  patients  admitted  to  hospitals  in  Northern  Israel.  Eur  J  Clin  Microbiol  Infect  Dis.  2016;35(1):149-154.
  18. Peretz  A,  Tkhawkho  L  Pastukh  N,  Brodsky  D,  Namimi  Halevi  C,  Nitzan  O.  Correlation  between  fecal  calprotectin  levels,  disease  severity  and  the  hypervirulent  ribotype  027  strain  in  patients  with  Clostridium  difficile  infection.  BMC  Infect  Dis.  2016;16:309
  19. Shomer  I,  Avisar  A,  Desai  P,  Azriel  S,  Smollan  G,  Belausov  N,  Keller  N,  Glikman  D,  Maor  Y,  Peretz  A,  McClelland  M,  Rahav  G,  Gal-Mor  O.  Genetic  and  phenotypic  characterization  of  a  Salmonella  enterica  serovar  Enteritidis  emerging  strain  with  superior  intra-macrophage  replication  phenotype.  Front  Microbiol.  2016;7:1468.
  20. Yahalom  R,  Ghantous  Y,  Peretz  A,  Abu-Elnaaj  I.  The  possible  role  of  dental  Implants  in  the  etiology  and  prognosis  of  osteomyelitis:  a  retrospective  study.  Int  J  Oral  Max  Impl.  2016;31(15):1100-1109.
  21. Peretz  A,  Kuzniec  F,  Ganem  D,  Salman  N,  Qarawani  D,  Amir  O.  The  need  for  maximal  sterile  barrier  precaution  in  routine  interventional  coronary  procedures;  Microbiology  analysis.  Eur  J  Med  Res.  2016;21:45.
  22. Peretz  A,  Pastukh  N,  Nitzan  O.  Is  one  colony  enough?  J  Clin  Microbiol.  2016;7:1925.  
  23. Peretz  A,  Skuratovsky  A,  Khabra  E,  Adler  A,  Pastukh  N,  Barak  S,  Perlitz  Y,  Ben‐Ami  M  Kushnir  A.  Peripartum  maternal  transmission  of  extended-spectrum  β-lactamase  organism  to  newborn  infants.  Diagn  Microbiol  Infec  Dis.  2016;87:168-171.
  24. Nitzan  O,  Elias  M,  Peretz  A,  Saliba  W.  Role  of  Antibiotics  for  treatment  of  inflammatory  bowel  disease.  World  J  Gastroenterol.  2016;22(3):1078-1082.
  25. Peretz  A  ,Ben  Shlomo  I,  Nitzan  O,  Bonavina  L,  M.  Schaffer  P,  Schaffer  M.  Clostridium  difficile  infection:  associations  with  chemotherapy,  radiation  therapy,  and  targeting  therapy  treatments.  Curr  Med  Chem.  2016;23(39):4442-4449.
  26. Amar  N,  Peretz  A*,  Gerchman  Y*.  A  cheap,  simple  high  throughput  method  for  screening  native  Helicobacter  pylori  urease  inhibitors  using  a  recombinant  Escherichia  coli,  its  validation  and  demonstration  of  Pistacia  atlantica  methanolic  extract  effectivity  and  specificity.  J  Microbiol  Meth.  2017;133:40-45.  *These  two  authors  contributed  equally.
  27. Orlin  I,  Rokney  A,  Onn  A,  Glikman  D,  Peretz  A.  Hospital  clones  of  methicillin-resistant  Staphylococcus  aureus  are  carried  by  medical  students  even  before  healthcare  exposure.  Antimicrob  Resist  Infect  Control.  2017;23:6-15.
  28. Mizrahi  H*,  Peretz  A*,  Lesnik  R,  Aizenberg-Gershtein  Y,  Rodriguez-Martinez  S,  Sharaby  Y,  Pastukh  N,  Brettar  I,  Höfle  MG.  Halpern  M.  Comparison  of  sputum  microbiome  of  legionellosis-associated  patients  and  other  pneumonia  patients:  indications  for  polybacterial  infections  .  Scientific  Reports  2017;7:40114.   *These  two  authors  contributed  equally.
  29. Nitzan  O,  Brodsky  Y,  Edelstein  H,  Hershko  D,  Saliba  W,  Keness  Y,  Peretz  A,  Chazan  B.  Microbiologic  data  in  acute  cholecystitis:  ten  years’  experience  from  bile  cultures  obtained  during  percutaneous  cholecystostomy.  Surg  Infect.  2017;18(3):345-349.
  30. Sharaby  Y,  Rodríguez-Martínez  S,  Oks  O,  Pecellin  M,  Mizrahi  H,  Peretz  A,  Brettar  I,  Höfle  M,  Halpern  M.  Temperature-dependent  growth  modeling  of  environmental  and  clinical  Legionella  pneumophila  MLVA-genotypes.  Appl  Environ  Microbiol.  2017;83(8):e0329516.
  31. Tkhawkho  L,  Nitzan  O,  Pastukh  N,  Brodsky  D,  Jackson  K,  Peretz  A.  Antimicrobial susceptibility  of  Clostridium  difficile  isolates  in  Israel.  J  Glob  Antimicrob  Resist. 2017;17(10):161-164.
  32. Perlitz  Y,  Megory  E,  Nitzan  O,  Bouganim  T,  Younis  J,  Shapso  N,  Ben  Ami  M,  Peretz  A.  Enriched  culture  and  Xpert  Polimerase  Chain  Reaction  assay  of  Group  B  streptococcus  carrier  status  at  35-37  weeks'  gestation  to  labor  onset:  a  comparison.  J  Matern  Fetal  Neonatal  Med.  2017;(6):  1-5.
  33. Binyamin  D,  Pastukh  N,  On  A,  Paritsky  M,  Peretz  A.  Phenotypic  and  genotypic  correlation  as  expressed  in  Helicobacter  pylori  resistance  to  clarithromycin  and  fluoroquinolones.  Gut  Pathog.  2017;9:48
  34. Pastukh  N,  Binyamin  D,   On  A,  Paritsky  M,  Peretz  A.  GenoType®  HelicoDR  test  in comparison  to  histology  and  culture  for  Helicobacter  pylori  detection  and  identification  of  resistance  mutations  to  clarithromycin  and  fluoroquinolones.  Helicobacter.  2017;6(22)
  35. Hamo  Z,  Azrad  M,  Nitzan  O,  Sagi  A,   Tkhawkho  L,  Binyamin  D,  Peretz   A.  Role  of  single  procalcitonin  test  on  admission  as  a  biomarker  for  predicting  the  severity  of  Clostridium  difficile  infection.  Front  Microbiol.  2017;8:2532. 
  36. Peretz  A,  Zabari  L,  Pastukh  N,  Avital  N,  Masaphy  S.  In  vitro  antileishmanial  activity   of  a  black  morel:  Morchella  importuna.   Int  J  Med  Mushrooms.  2018;20:71-80.
  37. Sharaby  Y,  Rodríguez-Martínez  S,  Pecellin  M,  Sela  R,  Peretz  A,  Höfle  M,  Halpern  M,  Brettar  I.  Virulence  traits  of  environmental  and  clinical  Legionella  pneumophila  MLVA  genotypes.  Appl  Environ  Microbiol.  2018;84:429-518.
  38. Pastukh  N,  Peretz  A*,  Brodsky  D,  Isakovich   N,  Azrad  M,  On   A.  The  antimicrobial susceptibility  of  Helicobacter  pylori  in  strains  isolated  from  children  in  Israel.  J  Glob  Antimicrob  Resist.  2018;12:175-178. 

*These  two  authors  contributed  equally.  Corresponding  author

  1. Binyamin  D,  Nitzan  O,  Azrad  M,  Hamo  Z,  Koren  O,  Peretz  A.  In  vitro  activity  of  tedizolid,  dalbavancin,  and  ceftobiprole  against  Clostridium  difficile.  Front  Microbiol.2018;9:1256.
  2. Azrad  M,  Tkhawkho  L,  Isakovich  N,  Nitzan  O,  Peretz  A.  Antimicrobial  susceptibility  of  Campylobacter  jejuni  and  Campylobacter  coli  –  comparison  between  Etest  and  a  broth  dilution  method.  Ann  Clin  Mocrobiol  Antimicrob.  2018;17:23.
  3. Laviad-  Shitrit  S,  Sharaby  Y,  Izhaki  I,   Peretz  A*,  Halpern  M.   Antimicrobial  susceptibility  of  environmental  non-O1/non-O139  Vibrio  cholerae  isolates.  Front  Microbiol.  2018;19:1726.

*These  two  authors  contributed  equally.

  1. Azrad  M,  Hamo  Z,  Tkhawkho  L,  Peretz  A.  Elevated  serum  Immunoglobulin  A  levels  in  patients  with  Clostridium  difficile  infection  are  associated  with  mortality.  Pathogens  and  Disease.  2018;76:6
  2. Rozenfelda  K,  Nitzana  O,  Peretz  A.  Presence  of  anaerobic  bacteria  in  the  urinary  tract  of  catheterized  ICU  patients.  2018.   Eur  J  Clin  Microbiol  Infect  Dis.  2018;37(11):2131-2136.
  3. Low  M,  Almog  R,  Balicer  Ran  D,  Liberman  N,  Raz  R,  Peretz  A,  Nitzan  O.  Infectious  disease  burden  and  antibiotic  prescribing  in  primary  care  in   Israel.  Ann  Clin  Mocrobiol  Antimicrob.  2018;17:26.
  4. Regev-Yochay  G,  Reisenberg  K,  Katzir  M,  Wiener-Well  Y,  Rahav   G,  Strahilevitz  J,  Istomin  V,  Tsyba  E,  Peretz  A,  Khakshoor  S,  Dagan  R.  Pneumococcal  meningitis  in  adults  after  introduction  of  PCV7  and  PCV13,  Israel,  July  2009-June  2015.  Emerg  Infect  Dis.;2018  24(7):1275-1284.
  5. Tkhawkho  L,  Jackson  K,  Nitzan  O,  Peretz  A.  The  destruction  of  Clostridium  difficile  spores  colitis  using  acidic  electrolyzed  water.  Am  J  Infect  Control.  2015;43(7):19-22.
  6. Yeganeh  M,  Paritsky  M,  On  A,  Azrad  M,  Roshrosh  H,  Moalem  R,  Peretz  A.  Characteristics   of  antibiotic  resistance  of  H.  pylori  among  adult  Arab  and  Jewish  populations  in  northern  Israel.  Microb  Drug  Resist.  2019;25(1):103-107.
  7. Azrad  M,  Baum  M,  Rokney  A,  Levi  Y,  Peretz  A.  In  vitro  activity  of  tedizolid  and dalbavancin  against  MRSA  strains  is  dependent  on  infection  source.  Int  J  Infect  Dis.  2019;78;107-112.
  8. Azrad  M,  Keness  Y,  Nitzan  O,  Pastukh  N,  Tkhawkho  L,  Freidus  V,  Peretz  A.  Cheap  and  rapid  in-house  method  for  direct  identification  of  positive  blood  cultures  by  MALDI-TOF  MS  technology.  BMC  Infect  Dis.  2019;19(1):7.
  9. Nuriel-Ohayon  M,  Neuman  H,  Ziv  O,  Belogolovski  A,  Barsheshet  Y,  Bloch  N,  Uzan  A,  Lahav  R,  Peretz  A,  Frishman  S,  Hod  M,  Hadar  E,  Louzoun  Y,  Avni  O,  Koren  O.  Progesterone  increases  Bifidobacterium  relative  abundance  during  late  pregnancy.  Cell  Rep.  2019;27(3):730–736.
  10. Sharaby  Y,  Nitzan  O,  Brettar  I,  Höfle  M,  Peretz  A,  Halpern  M.  Antimicrobial  agent susceptibilities  of  Legionella  pneumophila  MLVA-8  genotypes.  Scientific  Reports  2019;9:6138. 

*These  two  authors  contributed  equally.

  1. Azrad  M,  Freidus  V,  Kassem  R,  Peretz  A.  Identification  of  dermatophytes  by  MALDI-TOF  MS  technology  in  the  clinical  laboratory.  Int.  J  Mass  Spectrom.  440  2019;:32-36.
  2. Mizrahi  S,  Hamo  Z,  Azrad  M,  Peretz  A.  Molecular  characterization  and  moxifloxacin  susceptibility  of  Clostridium  difficile.  Antibiotics.  2019:8;18.
  3. Azrad  M,  Danilov  E,  Goshen  S,  Nitzan  O,  Peretz  A.  Detection  of  Group  A  Streptococcus  in  pharyngitis  by  two  rapid  tests:  Comparison  of  the  BD  VeritorTM  and  the  QuikRead  go®  Strep  A.  Eur  J  Clin  Microbiol  Infect  Dis.  2019;38.6:1179-1185.
  4. Hamo  Z,  Azrad  M,  Nitzan  O  ,  Peretz  A.  Characterization  of  the  immune  response  during  infection  caused  by  Clostridioides  difficile.  Microorganisms.  2019:7;435.
  1. Golan  Shaposhnik  E,  Abozaid,  Grossman  T,  Marva  E,  On  A,  Azrad  M,  Peretz  A.  The prevalence  of  Cryptosporidium  among  children  hospitalized  due  to  gastrointestinal  symptoms  and  the  efficiency  of  diagnostic  methods  for  Cryptosporidium.  Am  J  Trop  Med  Hyg.  2019;101(1):160-163. 
  2. Grossman  T,  Ken-Dror  S,  Pavlotzky  E,  Vainer  J,  Gla  zer  Y,  Sagi  O,  Peretz  A,  Agmon  V,  Marva  E,  Valinsky  L.  Molecular  Typing  of  Cryptosporidium  in  Israel.  Plos  One. 2019;3;14(9):e0219977
  3. Perlitz  Y,  Saffoury  E,  Shabso  N,  Labai  A,  Namatiyof  J,  Nitzan  O,  Ben-Shlomo  I,  Azrad  M,  Ben-Ami  M,  Peretz  A.  Maternal  and  neonatal  outcome  of  asymptomatic  bacteriuria  at  term  pregnancy.  Pathogens  and  Disease.  2019;1:77(5).
  4. Peretz  A,  Naamneh  B,  Tkhawkho  L,  Nitzan  O.  High  rates  of  fosfomycin  resistance  in  Gram  negative  urinary  isolates  from  Israel.  Microb  Drug  Resist.  2019:25;408-412.
  5.   Kalish  T  ,    Miron  D,    Azrad  M,    Rechnitzer  H,    Ben-Amram  H,    Glikman  D,  Peretz  A.  Characteristics  of  hospitalised  patients  with  influenza  in  2015–2016  in  Northern  Israel:  three  circulating  strains  and  continued  fear  of  2009  A/H1N1.  Epidemiol  Infect.  2019;25:147
  6. Peretz  A,  Azrad  M,  Blum  A.  Influenza  virus  and  Atherosclerosis.  QJM:  An  International  Journal  of  Medicine.  2019;1;112(10):749-755.
  7. Azrad  M,  Tkhawkho  L,  Hamo  Z,  Peretz  A.  The  diagnostic  performance  and  accuracy  of  3  molecular  assays  for  the  detection  of  Clostridium  difficile  in  stool  samples,  compared  with  the  Xpert®  C.  difficile  assay.  J  Microbiol  Meth.  2020;168:105784.
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  9. Miller  D,  Martin  M,  Harel  N,  Tirosh  O,  Kustin  T,  Meir  M,   Sorek  N,  Gefen-Halevi  S,  Amit  S,  A  Vorontsov  O,  Shaag  A,  Wolf  D,  Peretz  A,  Shemer-Avni  Y,  Roif-Kaminsky  D,  Kopelman  N,  Huppert  A,  Koelle  K,  Stern  A.  Full  genome  viral  sequences  inform  patterns  of  SARS-CoV2  spread  into  and  within  Israel.  Nat  Commun.  2020;  11(1),  1-10.
  10. Peretz  A,  Tameri  O,   Azrad  M,  Barak  S,   Perlitz  Y,  Abu  Dahoud  W,  Ben‐Ami  M,  Kushnir  A.  Mycoplasma  and  Ureaplasma  carriage  in  pregnant  women:  the  prevalence  of  transmission  from  mother  to  newborn.  BMC  Pregnancy  Childb.  2020;  20(1),  1-7.
  11. Rohana  H,  Azrad  M,  Nitzan  O,  Adler  A,  Koren  O,  Peretz  A.  Characterization  of Clostridioides  difficile  strains,  the  disease  severity  and  the  microbial  changes  they  induce.  J  Clin  Med.2020;9.12.
  12. Nseir  WB,  Hussein  SHH,  Farah  R,  Mahamid  MN,  Khatib  HH,  Mograbi  JM,  Peretz  A,  Amara  AE.  Nonalcoholic  fatty  liver  disease  as  a  risk  factor  for  Clostridium  difficille-associated  diarrhea.  QJM:  An  International  Journal  of  Medicine.  2020;113.5:320-323.
  13. Graif  N,  Abozaid  S,  Peretz  A.  Trends in distribution and antibiotic resistance of bacteria  isolated  from  urine  cultures  of  children  in  northern  Israel  between  2010-2017.  Microb  Drug  Resist.   2020  ;26.11:  1342-1349
  14. Domanovich-Asor  T,  Motro  Y,  Khalfin  B,  Craddock  H,  Peretz  A,  Moran-Gilad  J.  Genomic  Analysis  of  Antimicrobial  Resistance  Genotype-to-Phenotype  Agreement  in  Helicobacter  pylori.  Microorganisms.2021;9.1. 
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 Accepted

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Last Updated Date : 07/08/2023